La Colección física cuenta con casi 11.000 documentos, es una de las más notables de entre las bibliotecas universitarias españolas. Destacan los 149 códices medievales y los más de mil manuscritos de los siglos XVI al XVIII. Actualmente se encuentra disponible y accesible en formato digital una parte de la colección.
Dioscórides cuenta con un millón de imágenes almacenadas de forma independiente y es además la base del Servicio de Reproducción de documentos del Fondo Histórico Complutense.
RBME Digital es un proyecto de Patrimonio Nacional que tiene como objetivo la publicación online de las colecciones bibliográficas da la Real Biblioteca del Monasterio de San Lorenzo de El Escorial.
Catálogo de manuscritos iluminados de la British Library
Proyecto formado por The British Library, la Bibliothèque nationale de France y The Polonsky Foundation para dar acceso digital a más de 800 manuscritos medievales
Manuscritos digitalizados de la Universidad de Berkeley
Manuscritos digitalizados de la Biblioteca de la Universidad de California
Incluye algunos manuscritos iluminados de gran relevancia como el Aberdeen Bestiary
Comprende los fondos digitalizados de la Bodleian Library y de seis Colleges de Oxford